Elektroforeesisüsteem koosneb kahest põhikomponendist: toiteallikast ja elektroforeesikambrist. Toiteallikas on toiteallikas. "Võim" on antud juhul elekter. Toiteallikast tulev elekter voolab ühes suunas elektroforeesikambri ühest otsast teise. Kambri katood ja anood tõmbavad ligi vastupidiselt laetud osakesi.
Elektroforeesikambri sees on kandik – täpsemalt valamisalus. Valamisalus koosneb järgmistest osadest: klaasplaat, mis läheb valualuse põhja. Geeli hoitakse valualuses. "Kamm" näeb välja nagu selle nimi. Kamm asetatakse valualuse küljel olevatesse piludesse. See asetatakse piludesse ENNE kuuma sulanud geeli valamist. Pärast geeli tahkumist võetakse kamm välja. Kammi "hambad" jätavad geeli sisse väikesed augud, mida me nimetame "kaevudeks". Kaevud tekivad siis, kui kuum sulanud geel kammi hammaste ümber tahkub. Kamm tõmmatakse välja pärast geeli jahutamist, jättes kaevud. Kaevud on koht, kuhu panna testitavad osakesed. Inimene peab olema väga ettevaatlik, et osakeste laadimisel geeli ei häiriks. Geeli lõhenemine või purunemine mõjutab tõenäoliselt teie tulemusi.